Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIML2Q8N7C3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIML2Q8N7C3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIML2Q8N7C3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms