Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
TMC3Q7Z5M5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMC3Q7Z5M5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMC3Q7Z5M5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms