Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC181Q5TID7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC181Q5TID7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC181Q5TID7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC181Q5TID7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC181Q5TID7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms