Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC3AQ59EK9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC3AQ59EK9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RUNDC3AQ59EK9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC3AQ59EK9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC3AQ59EK9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms