Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDNFQ49AH0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDNFQ49AH0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDNFQ49AH0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms