Protein–RNA interactions for Protein: Q16630

CPSF6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF6Q16630 FUBP1-207ENST00000480673 262 ntTSL 35.09□□□□□ -1.593e-17■■■■□ 21
CPSF6Q16630 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.677e-7■■■■□ 21
CPSF6Q16630 FUBP1-211ENST00000489495 2156 ntTSL 23.36□□□□□ -1.873e-17■■■■□ 21
CPSF6Q16630 ANKRD10-208ENST00000485844 641 ntTSL 27.52□□□□□ -1.213e-12■■■■□ 20.9
CPSF6Q16630 PHF14-214ENST00000521747 2479 ntTSL 222.4■■□□□ 1.181e-7■■■■□ 20.8
CPSF6Q16630 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 221.2■□□□□ 0.981e-7■■■■□ 20.8
CPSF6Q16630 PHF14-206ENST00000476009 1044 ntTSL 318.03■□□□□ 0.481e-7■■■■□ 20.8
CPSF6Q16630 PHF14-210ENST00000490957 4058 ntTSL 514.93□□□□□ -0.021e-7■■■■□ 20.8
CPSF6Q16630 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-7■■■■□ 20.8
CPSF6Q16630 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-7■■■■□ 20.8
CPSF6Q16630 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.869e-7■■■■□ 20.4
CPSF6Q16630 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.931e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.811e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 01e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 MIR210HG-202ENST00000528245 659 ntTSL 314.87□□□□□ -0.031e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.041e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 SNHG15-204ENST00000579383 731 ntTSL 212.92□□□□□ -0.341e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.41e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.561e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 SNHG15-201ENST00000438705 509 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.761e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 LEO1-203ENST00000558949 630 ntTSL 39.92□□□□□ -0.821e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.831e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 LEO1-202ENST00000315141 1981 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.911e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.941e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 DR1-203ENST00000481583 1244 ntTSL 1 (best)7.54□□□□□ -1.21e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.381e-5■■■■□ 20.2
CPSF6Q16630 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.927e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.897e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.877e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.877e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.097e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 ST7-217ENST00000446490 1694 ntTSL 57.74□□□□□ -1.177e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 ST7-228ENST00000490039 1689 ntTSL 57.12□□□□□ -1.277e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.287e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.357e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.447e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.487e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.737e-8■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-13■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-13■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 PRRC2C-208ENST00000476522 1931 ntTSL 511.94□□□□□ -0.52e-15■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.72e-15■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.962e-15■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.132e-15■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.332e-15■■■■□ 20.1
CPSF6Q16630 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.034e-7■■■■□ 20
CPSF6Q16630 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.14e-7■■■■□ 20
CPSF6Q16630 ZNF655-204ENST00000394163 4528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.54e-7■■■■□ 20
CPSF6Q16630 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.124e-7■■■■□ 20
CPSF6Q16630 ZNF655-207ENST00000419215 4346 ntTSL 1 (best)7.85□□□□□ -1.154e-7■■■■□ 20
CPSF6Q16630 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.513e-29■■■■□ 20
CPSF6Q16630 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.218e-7■■■■□ 19.9
CPSF6Q16630 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.128e-7■■■■□ 19.9
CPSF6Q16630 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.016e-7■■■■□ 19.9
CPSF6Q16630 DNTTIP2-203ENST00000460191 3084 ntTSL 214.35□□□□□ -0.117e-7■■■■□ 19.9
CPSF6Q16630 DNTTIP2-201ENST00000359208 2199 ntTSL 27.62□□□□□ -1.197e-7■■■■□ 19.9
CPSF6Q16630 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.677e-7■■■■□ 19.9
CPSF6Q16630 PRPF40A-204ENST00000450303 496 ntTSL 316.06■□□□□ 0.161e-15■■■■□ 19.8
CPSF6Q16630 PRPF40A-211ENST00000493468 1043 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.371e-15■■■■□ 19.8
CPSF6Q16630 PRPF40A-203ENST00000448428 490 ntTSL 511.94□□□□□ -0.51e-15■■■■□ 19.8
CPSF6Q16630 PRPF40A-210ENST00000489741 776 ntTSL 37.93□□□□□ -1.141e-15■■■■□ 19.8
CPSF6Q16630 HSP90AA1-205ENST00000555662 429 ntTSL 25.98□□□□□ -1.451e-17■■■■□ 19.7
CPSF6Q16630 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.492e-9■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-9■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-9■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.662e-9■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 IMMP2L-209ENST00000489381 856 ntTSL 57.86□□□□□ -1.152e-9■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.522e-9■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.362e-8■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 HNRNPL-212ENST00000601449 1918 ntTSL 516.69■□□□□ 0.262e-8■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 HNRNPL-207ENST00000598985 900 ntTSL 513.3□□□□□ -0.282e-8■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 HNRNPL-203ENST00000595164 2404 ntTSL 212.83□□□□□ -0.352e-8■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 HNRNPL-202ENST00000388749 1952 ntTSL 510.45□□□□□ -0.742e-8■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 HNRNPL-206ENST00000597731 3094 ntTSL 210.08□□□□□ -0.82e-8■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.261e-9■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.351e-9■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.511e-9■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.621e-9■■■■□ 19.4
CPSF6Q16630 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.378e-9■■■■□ 19.3
CPSF6Q16630 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.888e-9■■■■□ 19.3
CPSF6Q16630 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.748e-9■■■■□ 19.3
CPSF6Q16630 PPP1R3F-204ENST00000471261 503 ntTSL 311.86□□□□□ -0.518e-9■■■■□ 19.3
CPSF6Q16630 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.51□□□□□ -1.538e-9■■■■□ 19.3
CPSF6Q16630 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.273e-18■■■□□ 19.1
CPSF6Q16630 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.33e-18■■■□□ 19.1
CPSF6Q16630 KHSRP-202ENST00000594496 999 ntTSL 217.13■□□□□ 0.333e-18■■■□□ 19.1
CPSF6Q16630 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 516.36■□□□□ 0.213e-18■■■□□ 19.1
CPSF6Q16630 KHSRP-203ENST00000594745 379 ntTSL 313.17□□□□□ -0.33e-18■■■□□ 19.1
CPSF6Q16630 KHSRP-208ENST00000597656 328 ntTSL 57.96□□□□□ -1.143e-18■■■□□ 19.1
CPSF6Q16630 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.682e-9■■■□□ 19
CPSF6Q16630 ZNF451-209ENST00000502749 790 ntTSL 518.13■□□□□ 0.492e-9■■■□□ 19
CPSF6Q16630 ZNF451-216ENST00000510483 719 ntTSL 417.88■□□□□ 0.452e-9■■■□□ 19
CPSF6Q16630 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-9■■■□□ 19
CPSF6Q16630 ZNF451-207ENST00000444273 3402 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.042e-9■■■□□ 19
CPSF6Q16630 ZNF451-213ENST00000508603 538 ntTSL 415.25■□□□□ 0.032e-9■■■□□ 19
CPSF6Q16630 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-9■■■□□ 19
CPSF6Q16630 ZNF451-206ENST00000370711 609 ntTSL 412.17□□□□□ -0.462e-9■■■□□ 19
CPSF6Q16630 ZNF451-217ENST00000510989 558 ntTSL 510.07□□□□□ -0.82e-9■■■□□ 19
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