Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PNP-207ENST00000556754 2573 ntTSL 29.42□□□□□ -0.91e-25■■■■■ 63.3
EFTUD2Q15029 RNF123-211ENST00000494005 557 ntTSL 314.14□□□□□ -0.157e-10■■■■■ 63.2
EFTUD2Q15029 ATXN2L-217ENST00000565845 750 ntTSL 517.02■□□□□ 0.324e-13■■■■■ 63.2
EFTUD2Q15029 RNH1-223ENST00000533592 2344 nt22.02■■□□□ 1.123e-10■■■■■ 63.1
EFTUD2Q15029 RNH1-219ENST00000531223 572 ntTSL 314.25□□□□□ -0.133e-10■■■■■ 63.1
EFTUD2Q15029 YIPF2-208ENST00000589971 879 ntTSL 219.34■□□□□ 0.694e-12■■■■■ 63.1
EFTUD2Q15029 YIPF2-212ENST00000592646 950 ntTSL 316.59■□□□□ 0.254e-12■■■■■ 63.1
EFTUD2Q15029 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.373e-7■■■■■ 63
EFTUD2Q15029 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 222.5■■□□□ 1.193e-7■■■■■ 63
EFTUD2Q15029 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 63
EFTUD2Q15029 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 63
EFTUD2Q15029 INTS11-219ENST00000490853 704 ntTSL 318.45■□□□□ 0.542e-14■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 INTS11-220ENST00000493534 896 ntTSL 318.34■□□□□ 0.532e-14■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 INTS11-239ENST00000531019 549 ntTSL 418.24■□□□□ 0.512e-14■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 INTS11-224ENST00000498476 554 ntTSL 418.24■□□□□ 0.512e-14■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 INTS11-215ENST00000470679 584 ntTSL 517.03■□□□□ 0.322e-14■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 INTS11-226ENST00000525285 579 ntTSL 414.55□□□□□ -0.082e-14■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 INTS11-244ENST00000532952 773 ntTSL 313.31□□□□□ -0.282e-14■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 INTS11-246ENST00000534345 485 ntTSL 411.95□□□□□ -0.52e-14■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 KMT5A-207ENST00000478781 725 ntTSL 527■■□□□ 1.913e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 FLYWCH1-204ENST00000570425 721 ntTSL 326.61■■□□□ 1.853e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 NADK-206ENST00000464373 722 ntTSL 225.52■■□□□ 1.682e-12■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.633e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 CHID1-217ENST00000530939 571 ntTSL 424.9■■□□□ 1.583e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.393e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.281e-6■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 YIF1A-213ENST00000534374 540 ntTSL 221.8■■□□□ 1.083e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.983e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.973e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 RGS14-208ENST00000509289 414 ntTSL 320.73■□□□□ 0.913e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZBTB14-205ENST00000582388 825 ntTSL 220.54■□□□□ 0.883e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 UBL5-203ENST00000588141 573 ntTSL 420.32■□□□□ 0.843e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 UBL5-204ENST00000588595 546 ntTSL 220.32■□□□□ 0.843e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 FLYWCH1-207ENST00000571140 359 ntTSL 519.85■□□□□ 0.773e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 BRF1-215ENST00000549655 1962 ntTSL 219.72■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.723e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 KMT5A-205ENST00000461103 1000 ntTSL 219.51■□□□□ 0.713e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-210ENST00000457927 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.31■□□□□ 0.683e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 MYO1C-213ENST00000573961 443 ntTSL 219.11■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 FLYWCH1-210ENST00000573525 643 ntTSL 318.7■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.443e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-208ENST00000444233 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.39■□□□□ 0.373e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 UBL5-206ENST00000589960 307 ntTSL 317.27■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 UBL5-205ENST00000589372 1450 ntTSL 217.26■□□□□ 0.353e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.353e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.233e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TERT-205ENST00000503656 406 ntTSL 316.3■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.173e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 EEF1D-227ENST00000529576 424 ntTSL 215.79■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.093e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 EEF1D-229ENST00000530109 533 ntTSL 215.44■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-213ENST00000489026 800 ntTSL 214.65□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 BRF1-220ENST00000552127 778 ntTSL 414.51□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZC3HC1-210ENST00000483827 760 ntTSL 514.05□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 CCDC124-204ENST00000602080 609 ntTSL 514.03□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZC3HC1-211ENST00000484432 559 ntTSL 413.78□□□□□ -0.23e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZC3HC1-205ENST00000470651 567 ntTSL 413.78□□□□□ -0.23e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 NOP53-202ENST00000594182 303 ntTSL 313.77□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-211ENST00000463857 3937 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.243e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 SPG7-205ENST00000561945 411 ntTSL 313.5□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 CHID1-222ENST00000533059 578 ntTSL 313.31□□□□□ -0.283e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZC3HC1-203ENST00000360708 1676 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.343e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 CHID1-211ENST00000528154 594 ntTSL 412.42□□□□□ -0.423e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZBTB14-208ENST00000615385 3350 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.463e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZC3HC1-209ENST00000481503 1741 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZC3HC1-202ENST00000358303 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.513e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 MCM2-202ENST00000468414 1076 ntTSL 211.65□□□□□ -0.543e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZC3HC1-201ENST00000311873 2017 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 BRF1-207ENST00000546417 554 ntTSL 310.98□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 CHID1-208ENST00000525225 523 ntTSL 510.73□□□□□ -0.693e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 RGS14-203ENST00000502731 472 ntTSL 210.66□□□□□ -0.73e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 SPG7-216ENST00000567138 1361 ntTSL 210.6□□□□□ -0.713e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZC3HC1-204ENST00000467642 1934 ntTSL 29.8□□□□□ -0.843e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 MCM5-206ENST00000451351 450 ntTSL 49.75□□□□□ -0.853e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 CHID1-221ENST00000533056 752 ntTSL 39.43□□□□□ -0.93e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ETV3-202ENST00000368192 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.923e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 CHID1-209ENST00000525840 438 ntTSL 39.15□□□□□ -0.943e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZC3HC1-206ENST00000471022 978 ntTSL 59.13□□□□□ -0.953e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ETV3-203ENST00000460850 696 ntTSL 29.11□□□□□ -0.953e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 TEX264-214ENST00000493444 554 ntTSL 39.08□□□□□ -0.963e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 ZC3HC1-208ENST00000480193 563 ntTSL 38.66□□□□□ -1.023e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.563e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.663e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.93e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.263e-9■■■■■ 62.8
EFTUD2Q15029 PLCG1-215ENST00000608689 969 ntTSL 513.61□□□□□ -0.238e-15■■■■■ 62.7
EFTUD2Q15029 PLCG1-217ENST00000609257 956 ntTSL 513.04□□□□□ -0.328e-15■■■■■ 62.7
EFTUD2Q15029 PLCG1-204ENST00000461641 936 ntTSL 511.44□□□□□ -0.588e-15■■■■■ 62.7
EFTUD2Q15029 PLCG1-214ENST00000607954 1005 ntTSL 511.18□□□□□ -0.628e-15■■■■■ 62.7
EFTUD2Q15029 PLCG1-216ENST00000608885 865 ntTSL 58.04□□□□□ -1.128e-15■■■■■ 62.7
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