RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534374.1

YIF1A-213, Transcript of Yip1 interacting factor homolog A, membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene YIF1A, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIF1A-213ENST00000534374 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.45■■■■■ 6.79
YIF1A-213ENST00000534374 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.25■■■■■ 5.79
YIF1A-213ENST00000534374 ABCC9O60706 1549 aa50.75■■■■■ 5.71
YIF1A-213ENST00000534374 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.58■■■■■ 5.37
YIF1A-213ENST00000534374 NACADO15069 1562 aa48.42■■■■■ 5.34
YIF1A-213ENST00000534374 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.31■■■■■ 5.32
YIF1A-213ENST00000534374 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.98■■■■■ 5.27
YIF1A-213ENST00000534374 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.68■■■■■ 5.22
YIF1A-213ENST00000534374 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.53■■■■■ 5.2
YIF1A-213ENST00000534374 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.42■■■■■ 5.18
YIF1A-213ENST00000534374 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.4■■■■■ 5.18
YIF1A-213ENST00000534374 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.38■■■■■ 5.18
YIF1A-213ENST00000534374 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.11■■■■■ 5.13
YIF1A-213ENST00000534374 SCRIBQ14160 1630 aa46.67■■■■■ 5.06
YIF1A-213ENST00000534374 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.63■■■■■ 5.05
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YIF1A-213ENST00000534374 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.88■■■■■ 4.93
YIF1A-213ENST00000534374 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.71■■■■■ 4.91
YIF1A-213ENST00000534374 NCAPD3P42695 1498 aa44.73■■■■■ 4.75
YIF1A-213ENST00000534374 SMARCA4P51532 1647 aa44.63■■■■■ 4.73
YIF1A-213ENST00000534374 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.62■■■■■ 4.73
YIF1A-213ENST00000534374 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
YIF1A-213ENST00000534374 SMARCA2P51531 1590 aa44.52■■■■■ 4.72
YIF1A-213ENST00000534374 HMGXB3Q12766 1538 aa44.36■■■■■ 4.69
YIF1A-213ENST00000534374 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.26■■■■■ 4.68
YIF1A-213ENST00000534374 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.22■■■■■ 4.67
YIF1A-213ENST00000534374 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
YIF1A-213ENST00000534374 ERCC6Q03468 1493 aa43.81■■■■■ 4.6
YIF1A-213ENST00000534374 NESP48681 1621 aa43.73■■■■■ 4.59
YIF1A-213ENST00000534374 CUX2O14529 1486 aa43.73■■■■■ 4.59
YIF1A-213ENST00000534374 WIZO95785 1651 aa43.68■■■■■ 4.58
YIF1A-213ENST00000534374 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.65■■■■■ 4.58
YIF1A-213ENST00000534374 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.57■■■■■ 4.57
YIF1A-213ENST00000534374 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
YIF1A-213ENST00000534374 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.41■■■■■ 4.54
YIF1A-213ENST00000534374 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.38■■■■■ 4.53
YIF1A-213ENST00000534374 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
YIF1A-213ENST00000534374 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
YIF1A-213ENST00000534374 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.13■■■■■ 4.49
YIF1A-213ENST00000534374 CFTRP13569 1480 aa42.99■■■■■ 4.47
YIF1A-213ENST00000534374 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.88■■■■■ 4.46
YIF1A-213ENST00000534374 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.83■■■■■ 4.45
YIF1A-213ENST00000534374 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.81■■■■■ 4.44
YIF1A-213ENST00000534374 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.75■■■■■ 4.43
YIF1A-213ENST00000534374 WDR62O43379 1518 aa42.75■■■■■ 4.43
YIF1A-213ENST00000534374 PRDM2Q13029 1718 aa42.46■■■■■ 4.39
YIF1A-213ENST00000534374 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
YIF1A-213ENST00000534374 ABCC8Q09428 1581 aa42.12■■■■■ 4.33
YIF1A-213ENST00000534374 TOPBP1Q92547 1522 aa42.07■■■■■ 4.33
YIF1A-213ENST00000534374 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
YIF1A-213ENST00000534374 IFT140Q96RY7 1462 aa41.98■■■■■ 4.31
YIF1A-213ENST00000534374 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.95■■■■■ 4.31
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YIF1A-213ENST00000534374 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
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YIF1A-213ENST00000534374 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
YIF1A-213ENST00000534374 SOGA1O94964 1423 aa41.56■■■■■ 4.24
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YIF1A-213ENST00000534374 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.5■■■■■ 4.23
YIF1A-213ENST00000534374 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
YIF1A-213ENST00000534374 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
YIF1A-213ENST00000534374 WDR97A6NE52 1622 aa41.3■■■■■ 4.2
YIF1A-213ENST00000534374 FBLN2P98095 1184 aa41.19■■■■■ 4.18
YIF1A-213ENST00000534374 CHD1O14646 1710 aa41.12■■■■■ 4.17
YIF1A-213ENST00000534374 GRIN2BQ13224 1484 aa41.11■■■■■ 4.17
YIF1A-213ENST00000534374 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.08■■■■■ 4.17
YIF1A-213ENST00000534374 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.08■■■■■ 4.17
YIF1A-213ENST00000534374 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.08■■■■■ 4.17
YIF1A-213ENST00000534374 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
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YIF1A-213ENST00000534374 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.05■■■■■ 4.16
YIF1A-213ENST00000534374 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.05■■■■■ 4.16
YIF1A-213ENST00000534374 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.03■■■■■ 4.16
YIF1A-213ENST00000534374 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
YIF1A-213ENST00000534374 TOP2BQ02880 1626 aa41■■■■■ 4.15
YIF1A-213ENST00000534374 ARHGEF11O15085 1522 aa40.99■■■■■ 4.15
YIF1A-213ENST00000534374 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.96■■■■■ 4.15
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YIF1A-213ENST00000534374 SYNJ2O15056 1496 aa40.9■■■■■ 4.14
YIF1A-213ENST00000534374 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.89■■■■■ 4.14
YIF1A-213ENST00000534374 PBRM1Q86U86 1689 aa40.85■■■■■ 4.13
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YIF1A-213ENST00000534374 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.56■■■■■ 4.08
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YIF1A-213ENST00000534374 ADAMTS12P58397 1594 aa40.52■■■■■ 4.08
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YIF1A-213ENST00000534374 CEP170Q5SW79 1584 aa40.32■■■■■ 4.05
YIF1A-213ENST00000534374 KIF27Q86VH2 1401 aa40.29■■■■■ 4.04
YIF1A-213ENST00000534374 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
YIF1A-213ENST00000534374 IGF1RP08069 1367 aa40.25■■■■■ 4.03
YIF1A-213ENST00000534374 SHROOM2Q13796 1616 aa40.13■■■■■ 4.02
YIF1A-213ENST00000534374 JPH4Q96JJ6 628 aa40.12■■■■■ 4.01
YIF1A-213ENST00000534374 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.09■■■■■ 4.01
YIF1A-213ENST00000534374 CUL7Q14999 1698 aa40.03■■■■■ 4
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