Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPRL3Q12980 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPRL3Q12980 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPRL3Q12980 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPRL3Q12980 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms