Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 PSP2YML017W 1782 nt8.82□□□□□ -1
TY3A-GQ12173 GID8YMR135C 1368 nt8.82□□□□□ -1
TY3A-GQ12173 LAT1YNL071W 1449 nt8.81□□□□□ -1
TY3A-GQ12173 PSD1YNL169C 1503 nt8.81□□□□□ -1
TY3A-GQ12173 RPD3YNL330C 1302 nt8.8□□□□□ -1
TY3A-GQ12173 HAC1YFL031W 717 nt8.79□□□□□ -1
TY3A-GQ12173 SPG1YGR236C 288 nt8.78□□□□□ -1
TY3A-GQ12173 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.78□□□□□ -1
TY3A-GQ12173 RHO1YPR165W 630 nt8.78□□□□□ -1
TY3A-GQ12173 YIR035CYIR035C 765 nt8.77□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt8.77□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 RNA170RNA170 169 nt8.77□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 YHL008CYHL008C 1884 nt8.77□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 YKL133CYKL133C 1392 nt8.76□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 SLM3YDL033C 1254 nt8.76□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 PMU1YKL128C 888 nt8.76□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 SRY1YKL218C 981 nt8.76□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 CPT1YNL130C 1182 nt8.75□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 CYT1YOR065W 930 nt8.75□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 YOR111WYOR111W 699 nt8.75□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 YOX1YML027W 1158 nt8.74□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 GTB1YDR221W 2109 nt8.74□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 THI73YLR004C 1572 nt8.73□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 DMA2YNL116W 1569 nt8.73□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 KRR1YCL059C 951 nt8.73□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 DOC1YGL240W 753 nt8.73□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 ZAP1YJL056C 2643 nt8.73□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 YJL144WYJL144W 315 nt8.72□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 TPO4YOR273C 1980 nt8.72□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 GGA2YHR108W 1758 nt8.71□□□□□ -1.01
TY3A-GQ12173 MAS2YHR024C 1449 nt8.71□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 MRS6YOR370C 1812 nt8.7□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 PIH1YHR034C 1035 nt8.7□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 SPR1YOR190W 1338 nt8.7□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 HMG2YLR450W 3138 nt8.69□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 PNS1YOR161C 1620 nt8.69□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 RSC4YKR008W 1878 nt8.68□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 YBL111CYBL111C 2004 nt8.68□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 PUP3YER094C 618 nt8.67□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 PRE10YOR362C 867 nt8.67□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 ODC1YPL134C 933 nt8.66□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 TOK1YJL093C 2076 nt8.65□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 POR2YIL114C 846 nt8.65□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 BUB2YMR055C 921 nt8.65□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.65□□□□□ -1.02
TY3A-GQ12173 JHD1YER051W 1479 nt8.64□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 ATP23YNR020C 813 nt8.64□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 TIM50YPL063W 1431 nt8.63□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 MAS1YLR163C 1389 nt8.63□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 RPC31YNL151C 756 nt8.63□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 YHR218WYHR218W 1812 nt8.63□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 GAL2YLR081W 1725 nt8.63□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 THI3YDL080C 1830 nt8.6□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.6□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 NCA3YJL116C 1014 nt8.6□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 TMS1YDR105C 1422 nt8.6□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 SHC1YER096W 1539 nt8.59□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 MEP1YGR121C 1479 nt8.59□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 AAD14YNL331C 1131 nt8.59□□□□□ -1.03
TY3A-GQ12173 MCP1YOR228C 909 nt8.58□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 HXK1YFR053C 1458 nt8.57□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 SSL2YIL143C 2532 nt8.57□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 CWP2YKL096W-A 279 nt8.57□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 GPM1YKL152C 744 nt8.57□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 AIM46YHR199C 933 nt8.56□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 YJL009WYJL009W 327 nt8.56□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 APT1YML022W 564 nt8.56□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 PTH2YBL057C 627 nt8.56□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 PUS4YNL292W 1212 nt8.56□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 ALD5YER073W 1563 nt8.56□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 AAC3YBR085W 924 nt8.54□□□□□ -1.04
TY3A-GQ12173 MDM35YKL053C-A 261 nt8.52□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 SPE3YPR069C 882 nt8.51□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 YDR467CYDR467C 327 nt8.5□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 HXT10YFL011W 1641 nt8.5□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 CRN1YLR429W 1956 nt8.5□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 LGE1YPL055C 999 nt8.49□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 CKI1YLR133W 1749 nt8.49□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 DPL1YDR294C 1770 nt8.48□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 MRS4YKR052C 915 nt8.48□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 CST26YBR042C 1194 nt8.48□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 YMC2YBR104W 990 nt8.48□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 PLB3YOL011W 2061 nt8.48□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 UME1YPL139C 1383 nt8.48□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 URA8YJR103W 1737 nt8.47□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 GAL83YER027C 1254 nt8.47□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 MSI1YBR195C 1269 nt8.47□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 FRA1YLL029W 2250 nt8.46□□□□□ -1.05
TY3A-GQ12173 STS1YIR011C 960 nt8.46□□□□□ -1.06
TY3A-GQ12173 YPQ1YOL092W 927 nt8.46□□□□□ -1.06
TY3A-GQ12173 ARG7YMR062C 1326 nt8.46□□□□□ -1.06
TY3A-GQ12173 HXT8YJL214W 1710 nt8.46□□□□□ -1.06
TY3A-GQ12173 YGL081WYGL081W 963 nt8.45□□□□□ -1.06
TY3A-GQ12173 TRR2YHR106W 1029 nt8.45□□□□□ -1.06
TY3A-GQ12173 YMR074CYMR074C 438 nt8.45□□□□□ -1.06
TY3A-GQ12173 YOR072WYOR072W 315 nt8.45□□□□□ -1.06
TY3A-GQ12173 YBR056WYBR056W 1506 nt8.44□□□□□ -1.06
TY3A-GQ12173 CYS3YAL012W 1185 nt8.44□□□□□ -1.06
TY3A-GQ12173 YJR142WYJR142W 1029 nt8.44□□□□□ -1.06
TY3A-GQ12173 PRS4YBL068W 981 nt8.44□□□□□ -1.06
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