Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 YRF1-2YER190W 5046 nt7.68□□□□□ -1.18
VPS68Q12016 YJL043WYJL043W 774 nt7.67□□□□□ -1.18
VPS68Q12016 TPN1YGL186C 1740 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS68Q12016 NPP2YEL016C 1482 nt7.66□□□□□ -1.18
VPS68Q12016 PUP3YER094C 618 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS68Q12016 YIL168WYIL168W 384 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS68Q12016 NUP53YMR153W 1428 nt7.65□□□□□ -1.18
VPS68Q12016 YHR218WYHR218W 1812 nt7.64□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 YBR056WYBR056W 1506 nt7.64□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 MFG1YDL233W 1377 nt7.64□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 FUS3YBL016W 1062 nt7.64□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 AGP3YFL055W 1677 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 PET494YNR045W 1470 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 AAT1YKL106W 1356 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 CYT1YOR065W 930 nt7.63□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 SHC1YER096W 1539 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 PSD1YNL169C 1503 nt7.62□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 PMU1YKL128C 888 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 MEP1YGR121C 1479 nt7.61□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 PRE10YOR362C 867 nt7.6□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 snR86snR86 1004 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 JHD1YER051W 1479 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 TIM50YPL063W 1431 nt7.59□□□□□ -1.19
VPS68Q12016 BAP3YDR046C 1815 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.58□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 YDR476CYDR476C 675 nt7.57□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 PRE5YMR314W 705 nt7.57□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 MTO1YGL236C 2010 nt7.56□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 EHT1YBR177C 1356 nt7.56□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 SDH8YBR269C 417 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 PSP2YML017W 1782 nt7.55□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 HOG1YLR113W 1308 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 LRO1YNR008W 1986 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 RCF1YML030W 480 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 HXT8YJL214W 1710 nt7.54□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 HAC1YFL031W 717 nt7.53□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 RRT6YGL146C 936 nt7.53□□□□□ -1.2
VPS68Q12016 CPT1YNL130C 1182 nt7.5□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 YLR358CYLR358C 564 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 SPR1YOR190W 1338 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 PNS1YOR161C 1620 nt7.49□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 YGR137WYGR137W 375 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 INO1YJL153C 1602 nt7.48□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 APT1YML022W 564 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 NDE2YDL085W 1638 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 THI6YPL214C 1623 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 TRP2YER090W 1524 nt7.47□□□□□ -1.21
VPS68Q12016 BUD31YCR063W 474 nt7.46□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 ARG7YMR062C 1326 nt7.46□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 WSC3YOL105C 1671 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 YPL247CYPL247C 1572 nt7.45□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 HIS3YOR202W 663 nt7.43□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 DIP5YPL265W 1827 nt7.43□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 ESBP6YNL125C 2022 nt7.42□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 TDA4YJR116W 840 nt7.42□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 YLR072WYLR072W 2082 nt7.42□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 FET5YFL041W 1869 nt7.41□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 NCA3YJL116C 1014 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 NBA1YOL070C 1506 nt7.4□□□□□ -1.22
VPS68Q12016 YIL177CYIL177C 5277 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 HXT11YOL156W 1704 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 YML079WYML079W 606 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 RPR1RPR1 369 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 MNN9YPL050C 1188 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 LEA1YPL213W 717 nt7.39□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 TGL5YOR081C 2250 nt7.38□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 HEL2YDR266C 1920 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 ALG7YBR243C 1347 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 ARO3YDR035W 1113 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 GLY1YEL046C 1164 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 SNP1YIL061C 903 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 MRP7YNL005C 1116 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 ABP1YCR088W 1779 nt7.37□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 INM1YHR046C 888 nt7.36□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 PUP2YGR253C 783 nt7.35□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 YNL140CYNL140C 570 nt7.35□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 TPO4YOR273C 1980 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 COS10YNR075W 1125 nt7.34□□□□□ -1.23
VPS68Q12016 TIF3YPR163C 1311 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 ERV2YPR037C 591 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 CRN1YLR429W 1956 nt7.33□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 CPR2YHR057C 618 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 STS1YIR011C 960 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 SRM1YGL097W 1449 nt7.32□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 WSC4YHL028W 1818 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 PIH1YHR034C 1035 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 TES1YJR019C 1050 nt7.31□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 STE3YKL178C 1413 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 MRN1YPL184C 1839 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 DST1YGL043W 930 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 YJR142WYJR142W 1029 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 ATP23YNR020C 813 nt7.3□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 MAS2YHR024C 1449 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 MAE1YKL029C 2010 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 RRP43YCR035C 1185 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 DOC1YGL240W 753 nt7.29□□□□□ -1.24
VPS68Q12016 SLM3YDL033C 1254 nt7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.8 ms