Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAGEA1P43355 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MAGEA1P43355 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MAGEA1P43355 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MAGEA1P43355 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms