Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPRR1BP22528 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms