Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF1P18846 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF1P18846 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF1P18846 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF1P18846 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF1P18846 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF1P18846 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF1P18846 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF1P18846 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF1P18846 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF1P18846 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF1P18846 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF1P18846 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF1P18846 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF1P18846 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF1P18846 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF1P18846 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF1P18846 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF1P18846 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF1P18846 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF1P18846 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF1P18846 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF1P18846 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF1P18846 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF1P18846 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF1P18846 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF1P18846 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF1P18846 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF1P18846 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF1P18846 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF1P18846 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF1P18846 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF1P18846 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF1P18846 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF1P18846 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF1P18846 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF1P18846 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF1P18846 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF1P18846 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF1P18846 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF1P18846 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF1P18846 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF1P18846 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF1P18846 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF1P18846 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF1P18846 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF1P18846 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF1P18846 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF1P18846 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF1P18846 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATF1P18846 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF1P18846 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF1P18846 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF1P18846 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF1P18846 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF1P18846 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF1P18846 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATF1P18846 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF1P18846 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATF1P18846 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF1P18846 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF1P18846 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF1P18846 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF1P18846 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF1P18846 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF1P18846 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF1P18846 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF1P18846 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATF1P18846 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF1P18846 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF1P18846 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF1P18846 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF1P18846 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF1P18846 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF1P18846 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF1P18846 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF1P18846 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF1P18846 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF1P18846 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF1P18846 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF1P18846 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF1P18846 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF1P18846 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF1P18846 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF1P18846 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF1P18846 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF1P18846 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF1P18846 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF1P18846 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF1P18846 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF1P18846 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF1P18846 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF1P18846 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF1P18846 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF1P18846 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF1P18846 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF1P18846 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF1P18846 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF1P18846 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF1P18846 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms