Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MGPP08493 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MGPP08493 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MGPP08493 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MGPP08493 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MGPP08493 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MGPP08493 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MGPP08493 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MGPP08493 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MGPP08493 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MGPP08493 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MGPP08493 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MGPP08493 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MGPP08493 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MGPP08493 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MGPP08493 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MGPP08493 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MGPP08493 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MGPP08493 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MGPP08493 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MGPP08493 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MGPP08493 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MGPP08493 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MGPP08493 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MGPP08493 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MGPP08493 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MGPP08493 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MGPP08493 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MGPP08493 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MGPP08493 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MGPP08493 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MGPP08493 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MGPP08493 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MGPP08493 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MGPP08493 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MGPP08493 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MGPP08493 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MGPP08493 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MGPP08493 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MGPP08493 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MGPP08493 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MGPP08493 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MGPP08493 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MGPP08493 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MGPP08493 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MGPP08493 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MGPP08493 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MGPP08493 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MGPP08493 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGPP08493 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGPP08493 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MGPP08493 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGPP08493 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGPP08493 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGPP08493 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGPP08493 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGPP08493 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGPP08493 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGPP08493 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGPP08493 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGPP08493 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGPP08493 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGPP08493 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGPP08493 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGPP08493 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGPP08493 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGPP08493 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGPP08493 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGPP08493 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGPP08493 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGPP08493 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGPP08493 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGPP08493 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGPP08493 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGPP08493 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGPP08493 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGPP08493 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGPP08493 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGPP08493 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGPP08493 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGPP08493 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MGPP08493 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGPP08493 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGPP08493 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGPP08493 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGPP08493 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGPP08493 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGPP08493 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGPP08493 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGPP08493 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGPP08493 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGPP08493 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGPP08493 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGPP08493 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGPP08493 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MGPP08493 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MGPP08493 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MGPP08493 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MGPP08493 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MGPP08493 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms