Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SLC8B1-205ENST00000548518 664 ntTSL 412.47□□□□□ -0.415e-10■■■■■ 66.5
DDX3XO00571 SLC8B1-208ENST00000549372 555 ntTSL 58.95□□□□□ -0.985e-10■■■■■ 66.5
DDX3XO00571 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 66.5
DDX3XO00571 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 66.5
DDX3XO00571 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.497e-18■■■■■ 66.3
DDX3XO00571 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.287e-18■■■■■ 66.3
DDX3XO00571 KIAA1524-205ENST00000487834 2014 ntTSL 1 (best)17.52■□□□□ 0.42e-15■■■■■ 66.3
DDX3XO00571 KIAA1524-204ENST00000481530 2764 ntTSL 1 (best)13.26□□□□□ -0.292e-15■■■■■ 66.3
DDX3XO00571 CHCHD4-203ENST00000420103 584 ntTSL 311.78□□□□□ -0.527e-18■■■■■ 66.3
DDX3XO00571 KIAA1524-202ENST00000461666 511 ntTSL 49.99□□□□□ -0.812e-15■■■■■ 66.3
DDX3XO00571 KIAA1524-203ENST00000468953 654 ntTSL 49.99□□□□□ -0.812e-15■■■■■ 66.3
DDX3XO00571 KIAA1524-201ENST00000295746 4075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-15■■■■■ 66.3
DDX3XO00571 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.242e-15■■■■■ 66.3
DDX3XO00571 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.72e-15■■■■■ 66.3
DDX3XO00571 TMEM248-204ENST00000424964 536 ntTSL 415.45■□□□□ 0.063e-13■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 TMEM248-203ENST00000418375 545 ntTSL 413.87□□□□□ -0.193e-13■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 TMEM248-202ENST00000413593 637 ntTSL 410.41□□□□□ -0.743e-13■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 HYAL2-203ENST00000415028 301 ntTSL 527.04■■□□□ 1.928e-50■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 HYAL2-209ENST00000458018 745 ntTSL 324.87■■□□□ 1.578e-50■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 HYAL2-205ENST00000426286 357 ntTSL 314.81□□□□□ -0.048e-50■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 HYAL2-204ENST00000424190 550 ntTSL 411.14□□□□□ -0.638e-50■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.061e-28■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 11e-28■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.851e-28■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.811e-28■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.751e-28■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.471e-28■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.351e-28■■■■■ 66.2
DDX3XO00571 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.088e-9■■■■■ 66
DDX3XO00571 DESI2-204ENST00000484738 1126 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.268e-9■■■■■ 66
DDX3XO00571 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.028e-9■■■■■ 66
DDX3XO00571 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.723e-15■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.263e-15■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.423e-15■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.433e-15■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.433e-15■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.53e-15■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 MOCS2-207ENST00000514553 795 ntTSL 25.65□□□□□ -1.53e-15■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.543e-15■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.543e-15■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 ICMT-202ENST00000474756 1227 ntTSL 224.15■■□□□ 1.463e-8■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 ICMT-203ENST00000489498 2612 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.43e-8■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 65.8
DDX3XO00571 ANO10-206ENST00000427171 746 ntTSL 517.22■□□□□ 0.351e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 ANO10-209ENST00000436073 497 ntTSL 416.66■□□□□ 0.261e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.231e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 ANO10-208ENST00000428831 641 ntTSL 515.89■□□□□ 0.131e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.131e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.081e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 ANO10-214ENST00000456438 545 ntTSL 412.65□□□□□ -0.381e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 ANO10-207ENST00000428472 592 ntTSL 412.36□□□□□ -0.431e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 ANO10-201ENST00000292246 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.661e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 ANO10-210ENST00000439141 560 ntTSL 46.06□□□□□ -1.441e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 ANO10-204ENST00000413397 511 ntTSL 45.37□□□□□ -1.551e-21■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 FAHD2A-203ENST00000445649 522 ntTSL 218.16■□□□□ 0.51e-22■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 FAHD2A-202ENST00000418606 715 ntTSL 318.13■□□□□ 0.491e-22■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.31e-22■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-22■■■■■ 65.7
DDX3XO00571 FAM50A-203ENST00000464419 1470 ntTSL 522.83■■□□□ 1.255e-12■■■■■ 65.6
DDX3XO00571 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.665e-12■■■■■ 65.6
DDX3XO00571 HTATSF1-202ENST00000425695 885 ntTSL 325.8■■□□□ 1.728e-9■■■■■ 65.4
DDX3XO00571 HTATSF1-203ENST00000448450 1014 ntTSL 525.8■■□□□ 1.728e-9■■■■■ 65.4
DDX3XO00571 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.778e-9■■■■■ 65.4
DDX3XO00571 TMEM184A-207ENST00000431208 579 ntTSL 421.55■■□□□ 1.045e-11■■■■■ 65.2
DDX3XO00571 TMEM184A-205ENST00000421923 744 ntTSL 521.55■■□□□ 1.045e-11■■■■■ 65.2
DDX3XO00571 TMEM184A-202ENST00000319010 866 ntTSL 516.58■□□□□ 0.245e-11■■■■■ 65.2
DDX3XO00571 JMJD8-214ENST00000569441 1428 ntTSL 531.93■■■□□ 2.71e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 JMJD8-212ENST00000568689 1998 ntTSL 331.89■■■□□ 2.71e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 JMJD8-209ENST00000567120 2205 ntTSL 1 (best)30.78■■■□□ 2.521e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.151e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.951e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 JMJD8-208ENST00000566199 719 ntTSL 326.79■■□□□ 1.881e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 JMJD8-213ENST00000569396 729 ntTSL 525.1■■□□□ 1.611e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.581e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 JMJD8-207ENST00000565302 1975 ntTSL 324.55■■□□□ 1.521e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-212ENST00000580717 855 ntTSL 523.14■■□□□ 1.291e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 CDK16-217ENST00000522234 1679 ntTSL 222.35■■□□□ 1.178e-20■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.111e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.061e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 JMJD8-210ENST00000567901 785 ntTSL 321.23■□□□□ 0.991e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 CDK16-216ENST00000520893 943 ntTSL 520.02■□□□□ 0.88e-20■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 CDK16-208ENST00000517426 1574 ntTSL 519.38■□□□□ 0.698e-20■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.698e-20■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.611e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 CDK16-213ENST00000519758 991 ntTSL 318.63■□□□□ 0.578e-20■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.481e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.311e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.318e-20■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.231e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.181e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.171e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 CDK16-215ENST00000520295 573 ntTSL 415.82■□□□□ 0.128e-20■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.041e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-207ENST00000579194 890 ntTSL 315.26■□□□□ 0.031e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 CDK16-209ENST00000517479 520 ntTSL 414.97□□□□□ -0.018e-20■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 CDK16-218ENST00000522883 601 ntTSL 414.93□□□□□ -0.028e-20■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.181e-14■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 CDK16-210ENST00000517997 562 ntTSL 413.65□□□□□ -0.228e-20■■■■■ 65.1
DDX3XO00571 MIF4GD-213ENST00000581777 696 ntTSL 213.59□□□□□ -0.231e-14■■■■■ 65.1
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