RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448450.5

HTATSF1-203, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene HTATSF1, Length 1,014 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-203ENST00000448450 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.22■■■■■ 7.39
HTATSF1-203ENST00000448450 ABCC9O60706 1549 aa55.33■■■■■ 6.45
HTATSF1-203ENST00000448450 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.17■■■■■ 6.42
HTATSF1-203ENST00000448450 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.62■■■■■ 6.01
HTATSF1-203ENST00000448450 NACADO15069 1562 aa52.17■■■■■ 5.94
HTATSF1-203ENST00000448450 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.04■■■■■ 5.92
HTATSF1-203ENST00000448450 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.73■■■■■ 5.87
HTATSF1-203ENST00000448450 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.44■■■■■ 5.82
HTATSF1-203ENST00000448450 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.4■■■■■ 5.82
HTATSF1-203ENST00000448450 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.36■■■■■ 5.81
HTATSF1-203ENST00000448450 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.04■■■■■ 5.76
HTATSF1-203ENST00000448450 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.7■■■■■ 5.71
HTATSF1-203ENST00000448450 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.59■■■■■ 5.69
HTATSF1-203ENST00000448450 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.42■■■■■ 5.66
HTATSF1-203ENST00000448450 SCRIBQ14160 1630 aa50.19■■■■■ 5.63
HTATSF1-203ENST00000448450 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50■■■■■ 5.6
HTATSF1-203ENST00000448450 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.89■■■■■ 5.58
HTATSF1-203ENST00000448450 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.84■■■■■ 5.57
HTATSF1-203ENST00000448450 NCAPD3P42695 1498 aa48.11■■■■■ 5.29
HTATSF1-203ENST00000448450 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.07■■■■■ 5.29
HTATSF1-203ENST00000448450 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.92■■■■■ 5.26
HTATSF1-203ENST00000448450 CUX2O14529 1486 aa47.86■■■■■ 5.25
HTATSF1-203ENST00000448450 SMARCA4P51532 1647 aa47.86■■■■■ 5.25
HTATSF1-203ENST00000448450 ERCC6Q03468 1493 aa47.85■■■■■ 5.25
HTATSF1-203ENST00000448450 SMARCA2P51531 1590 aa47.85■■■■■ 5.25
HTATSF1-203ENST00000448450 HMGXB3Q12766 1538 aa47.8■■■■■ 5.24
HTATSF1-203ENST00000448450 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.59■■■■■ 5.21
HTATSF1-203ENST00000448450 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
HTATSF1-203ENST00000448450 NESP48681 1621 aa47.44■■■■■ 5.18
HTATSF1-203ENST00000448450 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.4■■■■■ 5.18
HTATSF1-203ENST00000448450 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.15■■■■■ 5.14
HTATSF1-203ENST00000448450 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.15■■■■■ 5.14
HTATSF1-203ENST00000448450 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
HTATSF1-203ENST00000448450 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.9■■■■■ 5.1
HTATSF1-203ENST00000448450 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.85■■■■■ 5.09
HTATSF1-203ENST00000448450 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.62■■■■■ 5.05
HTATSF1-203ENST00000448450 WIZO95785 1651 aa46.59■■■■■ 5.05
HTATSF1-203ENST00000448450 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.47■■■■■ 5.03
HTATSF1-203ENST00000448450 WDR62O43379 1518 aa46.38■■■■■ 5.01
HTATSF1-203ENST00000448450 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.28■■■■■ 5
HTATSF1-203ENST00000448450 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.25■■■■■ 4.99
HTATSF1-203ENST00000448450 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.13■■■■■ 4.98
HTATSF1-203ENST00000448450 CFTRP13569 1480 aa46.06■■■■■ 4.96
HTATSF1-203ENST00000448450 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
HTATSF1-203ENST00000448450 TRIM41Q8WV44 630 aa45.86■■■■■ 4.93
HTATSF1-203ENST00000448450 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
HTATSF1-203ENST00000448450 PRDM2Q13029 1718 aa45.7■■■■■ 4.91
HTATSF1-203ENST00000448450 OSCARQ8IYS5 282 aa45.56■■■■■ 4.88
HTATSF1-203ENST00000448450 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.43■■■■■ 4.86
HTATSF1-203ENST00000448450 IFT140Q96RY7 1462 aa45.31■■■■■ 4.84
HTATSF1-203ENST00000448450 TOPBP1Q92547 1522 aa45.22■■■■■ 4.83
HTATSF1-203ENST00000448450 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.22■■■■■ 4.83
HTATSF1-203ENST00000448450 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
HTATSF1-203ENST00000448450 ABCC8Q09428 1581 aa45.15■■■■■ 4.82
HTATSF1-203ENST00000448450 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.07■■■■■ 4.81
HTATSF1-203ENST00000448450 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.07■■■■■ 4.81
HTATSF1-203ENST00000448450 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.07■■■■■ 4.81
HTATSF1-203ENST00000448450 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.07■■■■■ 4.8
HTATSF1-203ENST00000448450 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
HTATSF1-203ENST00000448450 ARHGEF11O15085 1522 aa44.89■■■■■ 4.78
HTATSF1-203ENST00000448450 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
HTATSF1-203ENST00000448450 CHD1O14646 1710 aa44.77■■■■■ 4.76
HTATSF1-203ENST00000448450 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.76■■■■■ 4.762e-8■■■■■ 35.8
HTATSF1-203ENST00000448450 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
HTATSF1-203ENST00000448450 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.54■■■■■ 4.72
HTATSF1-203ENST00000448450 FBLN2P98095 1184 aa44.54■■■■■ 4.72
HTATSF1-203ENST00000448450 SOGA1O94964 1423 aa44.5■■■■■ 4.71
HTATSF1-203ENST00000448450 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.5■■■■■ 4.71
HTATSF1-203ENST00000448450 WDR97A6NE52 1622 aa44.46■■■■■ 4.71
HTATSF1-203ENST00000448450 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.71
HTATSF1-203ENST00000448450 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.43■■■■■ 4.7
HTATSF1-203ENST00000448450 ARAP1Q96P48 1450 aa44.4■■■■■ 4.7
HTATSF1-203ENST00000448450 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.35■■■■■ 4.69
HTATSF1-203ENST00000448450 CUX1P39880 1505 aa44.34■■■■■ 4.69
HTATSF1-203ENST00000448450 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
HTATSF1-203ENST00000448450 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.21■■■■■ 4.67
HTATSF1-203ENST00000448450 SYNJ1O43426 1573 aa44.2■■■■■ 4.67
HTATSF1-203ENST00000448450 GRIN2BQ13224 1484 aa44.2■■■■■ 4.67
HTATSF1-203ENST00000448450 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
HTATSF1-203ENST00000448450 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.66
HTATSF1-203ENST00000448450 SYNJ2O15056 1496 aa44.09■■■■■ 4.65
HTATSF1-203ENST00000448450 PBRM1Q86U86 1689 aa44.07■■■■■ 4.64
HTATSF1-203ENST00000448450 GAPVD1Q14C86 1478 aa44■■■■■ 4.63
HTATSF1-203ENST00000448450 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.91■■■■■ 4.62
HTATSF1-203ENST00000448450 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.91■■■■■ 4.62
HTATSF1-203ENST00000448450 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.68■■■■■ 4.58
HTATSF1-203ENST00000448450 GRIN2AQ12879 1464 aa43.64■■■■■ 4.58
HTATSF1-203ENST00000448450 ADAMTS12P58397 1594 aa43.61■■■■■ 4.57
HTATSF1-203ENST00000448450 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.61■■■■■ 4.57
HTATSF1-203ENST00000448450 TOP2BQ02880 1626 aa43.59■■■■■ 4.57
HTATSF1-203ENST00000448450 CEP170Q5SW79 1584 aa43.49■■■■■ 4.55
HTATSF1-203ENST00000448450 NUP160Q12769 1436 aa43.48■■■■■ 4.55
HTATSF1-203ENST00000448450 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.46■■■■■ 4.55
HTATSF1-203ENST00000448450 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.43■■■■■ 4.54
HTATSF1-203ENST00000448450 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.38■■■■■ 4.54
HTATSF1-203ENST00000448450 SHROOM2Q13796 1616 aa43.36■■■■■ 4.53
HTATSF1-203ENST00000448450 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
HTATSF1-203ENST00000448450 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
HTATSF1-203ENST00000448450 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.01■■■■■ 4.48
HTATSF1-203ENST00000448450 JPH4Q96JJ6 628 aa42.97■■■■■ 4.47
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