Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXI3A8MTJ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXI3A8MTJ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXI3A8MTJ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXI3A8MTJ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXI3A8MTJ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXI3A8MTJ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXI3A8MTJ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXI3A8MTJ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXI3A8MTJ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXI3A8MTJ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms