Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SSPOA2VEC9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SSPOA2VEC9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SSPOA2VEC9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SSPOA2VEC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SSPOA2VEC9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SSPOA2VEC9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSPOA2VEC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSPOA2VEC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSPOA2VEC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSPOA2VEC9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSPOA2VEC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSPOA2VEC9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSPOA2VEC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSPOA2VEC9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSPOA2VEC9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSPOA2VEC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSPOA2VEC9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSPOA2VEC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSPOA2VEC9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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