Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NECAP2Q9NVZ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms