Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms