Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms