Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NECAP2Q9NVZ3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms