Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
WDR53Q7Z5U6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms