Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFLP07196 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFLP07196 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFLP07196 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFLP07196 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFLP07196 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFLP07196 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFLP07196 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFLP07196 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFLP07196 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms