Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NECAP2Q9NVZ3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms