Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE82

SH3TC1, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC1Q8TE82 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3TC1Q8TE82 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3TC1Q8TE82 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3TC1Q8TE82 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3TC1Q8TE82 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3TC1Q8TE82 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3TC1Q8TE82 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3TC1Q8TE82 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3TC1Q8TE82 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3TC1Q8TE82 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3TC1Q8TE82 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3TC1Q8TE82 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3TC1Q8TE82 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms