Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARID3CA6NKF2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARID3CA6NKF2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms