Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM106CQ9BVX2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM106CQ9BVX2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms