Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCSO14618 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCSO14618 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCSO14618 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCSO14618 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCSO14618 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSO14618 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSO14618 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSO14618 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSO14618 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSO14618 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSO14618 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSO14618 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSO14618 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms