Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEST4Q8NFU0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEST4Q8NFU0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BEST4Q8NFU0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEST4Q8NFU0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BEST4Q8NFU0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEST4Q8NFU0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEST4Q8NFU0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEST4Q8NFU0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms