Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms