Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC82Q8N4S0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms