Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNE4Q8N205 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNE4Q8N205 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms