Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB1P53618 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB1P53618 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB1P53618 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB1P53618 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB1P53618 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB1P53618 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB1P53618 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB1P53618 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPB1P53618 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPB1P53618 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPB1P53618 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPB1P53618 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB1P53618 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB1P53618 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms