Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNE2O96020 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNE2O96020 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms