Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms