Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
WDR53Q7Z5U6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms