Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms