Protein–RNA interactions for Protein: P55268

LAMB2, Laminin subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB2P55268 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMB2P55268 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMB2P55268 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms