Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
J3KRW8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
J3KRW8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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J3KRW8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
J3KRW8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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J3KRW8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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J3KRW8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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J3KRW8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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J3KRW8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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J3KRW8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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J3KRW8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
J3KRW8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
J3KRW8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
J3KRW8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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J3KRW8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
J3KRW8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
J3KRW8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
J3KRW8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
J3KRW8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
J3KRW8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
J3KRW8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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