Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EXT1Q16394 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EXT1Q16394 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms