Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KPNA2P52292 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms