Protein–RNA interactions for Protein: Q12150

CSF1, Protein CSF1, yeast

Predictions only

Length 2,958 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSF1	Q12150	YGR174W-A	YGR174W-A	87 nt		-3.17	□□□□□ -2.92
CSF1	Q12150	TSC3	YBR058C-A	243 nt		-3.17	□□□□□ -2.92
CSF1	Q12150	Q0255	Q0255	1419 nt		-3.17	□□□□□ -2.92
CSF1	Q12150	YAR047C	YAR047C	321 nt		-3.18	□□□□□ -2.92
CSF1	Q12150	YBL071C	YBL071C	309 nt		-3.18	□□□□□ -2.92
CSF1	Q12150	ATG16	YMR159C	453 nt		-3.2	□□□□□ -2.92
CSF1	Q12150	YPR012W	YPR012W	255 nt		-3.24	□□□□□ -2.93
CSF1	Q12150	YLR406C-A	YLR406C-A	150 nt		-3.27	□□□□□ -2.93
CSF1	Q12150	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-3.29	□□□□□ -2.94
CSF1	Q12150	YFL019C	YFL019C	354 nt		-3.29	□□□□□ -2.94
CSF1	Q12150	snR41	snR41	95 nt		-3.31	□□□□□ -2.94
CSF1	Q12150	YDL016C	YDL016C	303 nt		-3.32	□□□□□ -2.94
CSF1	Q12150	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-3.32	□□□□□ -2.94
CSF1	Q12150	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		-3.32	□□□□□ -2.94
CSF1	Q12150	YBR178W	YBR178W	375 nt		-3.32	□□□□□ -2.94
CSF1	Q12150	ATP6	Q0085	780 nt		-3.35	□□□□□ -2.95
CSF1	Q12150	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		-3.35	□□□□□ -2.95
CSF1	Q12150	Q0143	Q0143	153 nt		-3.41	□□□□□ -2.96
CSF1	Q12150	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-3.41	□□□□□ -2.96
CSF1	Q12150	YJR157W	YJR157W	363 nt		-3.45	□□□□□ -2.96
CSF1	Q12150	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-3.47	□□□□□ -2.97
CSF1	Q12150	YFL032W	YFL032W	321 nt		-3.52	□□□□□ -2.97
CSF1	Q12150	YDR413C	YDR413C	576 nt		-3.52	□□□□□ -2.97
CSF1	Q12150	YGR035C	YGR035C	351 nt		-3.56	□□□□□ -2.98
CSF1	Q12150	CSN9	YDR179C	489 nt		-3.62	□□□□□ -2.99
CSF1	Q12150	snR78	snR78	87 nt		-3.67	□□□□□ -3
CSF1	Q12150	RPL41A	YDL184C	78 nt		-3.7	□□□□□ -3
CSF1	Q12150	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		-3.72	□□□□□ -3.01
CSF1	Q12150	snR60	snR60	104 nt		-3.75	□□□□□ -3.01
CSF1	Q12150	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-3.78	□□□□□ -3.02
CSF1	Q12150	YGL041C	YGL041C	204 nt		-3.79	□□□□□ -3.02
CSF1	Q12150	snR54	snR54	86 nt		-3.83	□□□□□ -3.02
CSF1	Q12150	YEL014C	YEL014C	306 nt		-3.84	□□□□□ -3.02
CSF1	Q12150	snR58	snR58	96 nt		-3.86	□□□□□ -3.03
CSF1	Q12150	YNL028W	YNL028W	318 nt		-3.86	□□□□□ -3.03
CSF1	Q12150	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-3.87	□□□□□ -3.03
CSF1	Q12150	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-3.87	□□□□□ -3.03
CSF1	Q12150	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		-3.92	□□□□□ -3.04
CSF1	Q12150	YKL118W	YKL118W	312 nt		-3.96	□□□□□ -3.04
CSF1	Q12150	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		-3.97	□□□□□ -3.04
CSF1	Q12150	YOR102W	YOR102W	351 nt		-3.99	□□□□□ -3.05
CSF1	Q12150	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		-3.99	□□□□□ -3.05
CSF1	Q12150	RPL39	YJL189W	156 nt		-4	□□□□□ -3.05
CSF1	Q12150	YNL324W	YNL324W	396 nt		-4.01	□□□□□ -3.05
CSF1	Q12150	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-4.02	□□□□□ -3.05
CSF1	Q12150	YDR157W	YDR157W	402 nt		-4.02	□□□□□ -3.05
CSF1	Q12150	YER006C-A	YER006C-A	318 nt		-4.02	□□□□□ -3.05
CSF1	Q12150	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-4.02	□□□□□ -3.05
CSF1	Q12150	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-4.04	□□□□□ -3.06
CSF1	Q12150	YKL096C-B	YKL096C-B	150 nt		-4.05	□□□□□ -3.06
CSF1	Q12150	YLR434C	YLR434C	384 nt		-4.05	□□□□□ -3.06
CSF1	Q12150	snR38	snR38	95 nt		-4.07	□□□□□ -3.06
CSF1	Q12150	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-4.07	□□□□□ -3.06
CSF1	Q12150	YNL122C	YNL122C	348 nt		-4.1	□□□□□ -3.07
CSF1	Q12150	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-4.11	□□□□□ -3.07
CSF1	Q12150	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		-4.11	□□□□□ -3.07
CSF1	Q12150	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-4.11	□□□□□ -3.07
CSF1	Q12150	GIM4	YEL003W	336 nt		-4.14	□□□□□ -3.07
CSF1	Q12150	snR85	snR85	171 nt		-4.16	□□□□□ -3.07
CSF1	Q12150	HTL1	YCR020W-B	237 nt		-4.16	□□□□□ -3.08
CSF1	Q12150	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		-4.17	□□□□□ -3.08
CSF1	Q12150	snR56	snR56	88 nt		-4.18	□□□□□ -3.08
CSF1	Q12150	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-4.18	□□□□□ -3.08
CSF1	Q12150	tW(UCA)Q	tW(UCA)Q	74 nt		-4.18	□□□□□ -3.08
CSF1	Q12150	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-4.2	□□□□□ -3.08
CSF1	Q12150	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-4.26	□□□□□ -3.09
CSF1	Q12150	snR48	snR48	113 nt		-4.26	□□□□□ -3.09
CSF1	Q12150	snR34	snR34	203 nt		-4.29	□□□□□ -3.1
CSF1	Q12150	YGR151C	YGR151C	336 nt		-4.31	□□□□□ -3.1
CSF1	Q12150	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		-4.35	□□□□□ -3.11
CSF1	Q12150	YAL063C-A	YAL063C-A	291 nt		-4.43	□□□□□ -3.12
CSF1	Q12150	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		-4.48	□□□□□ -3.13
CSF1	Q12150	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-4.49	□□□□□ -3.13
CSF1	Q12150	tC(GCA)Q	tC(GCA)Q	76 nt		-4.57	□□□□□ -3.14
CSF1	Q12150	YKL123W	YKL123W	381 nt		-4.58	□□□□□ -3.14
CSF1	Q12150	YBL053W	YBL053W	375 nt		-4.58	□□□□□ -3.14
CSF1	Q12150	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-4.6	□□□□□ -3.15
CSF1	Q12150	snR47	snR47	99 nt		-4.61	□□□□□ -3.15
CSF1	Q12150	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-4.65	□□□□□ -3.15
CSF1	Q12150	SPG3	YDR504C	384 nt		-4.72	□□□□□ -3.17
CSF1	Q12150	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		-4.73	□□□□□ -3.17
CSF1	Q12150	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-4.8	□□□□□ -3.18
CSF1	Q12150	YKL225W	YKL225W	348 nt		-4.82	□□□□□ -3.18
CSF1	Q12150	YAL066W	YAL066W	309 nt		-4.86	□□□□□ -3.19
CSF1	Q12150	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-4.87	□□□□□ -3.19
CSF1	Q12150	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		-4.87	□□□□□ -3.19
CSF1	Q12150	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		-4.9	□□□□□ -3.19
CSF1	Q12150	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-4.91	□□□□□ -3.19
CSF1	Q12150	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-4.94	□□□□□ -3.2
CSF1	Q12150	snR52	snR52	92 nt		-4.94	□□□□□ -3.2
CSF1	Q12150	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-5.02	□□□□□ -3.21
CSF1	Q12150	YOR302W	YOR302W	78 nt		-5.04	□□□□□ -3.22
CSF1	Q12150	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-5.09	□□□□□ -3.22
CSF1	Q12150	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-5.25	□□□□□ -3.25
CSF1	Q12150	snR40	snR40	97 nt		-5.33	□□□□□ -3.26
CSF1	Q12150	YOR225W	YOR225W	330 nt		-5.33	□□□□□ -3.26
CSF1	Q12150	YLR285C-A	YLR285C-A	171 nt		-5.39	□□□□□ -3.27
CSF1	Q12150	YNR025C	YNR025C	360 nt		-5.45	□□□□□ -3.28
CSF1	Q12150	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-5.46	□□□□□ -3.28
CSF1	Q12150	snR64	snR64	101 nt		-5.7	□□□□□ -3.32

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