Protein–RNA interactions for Protein: P53855

ATG2, Autophagy-related protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG2P53855 snR41snR41 95 nt-4.59□□□□□ -3.14
ATG2P53855 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-4.61□□□□□ -3.15
ATG2P53855 STE18YJR086W 333 nt-4.63□□□□□ -3.15
ATG2P53855 YPR012WYPR012W 255 nt-4.63□□□□□ -3.15
ATG2P53855 ATP6Q0085 780 nt-4.67□□□□□ -3.16
ATG2P53855 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-4.73□□□□□ -3.17
ATG2P53855 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-4.73□□□□□ -3.17
ATG2P53855 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-4.74□□□□□ -3.17
ATG2P53855 snR73snR73 106 nt-4.76□□□□□ -3.17
ATG2P53855 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-4.78□□□□□ -3.17
ATG2P53855 snR80snR80 171 nt-4.81□□□□□ -3.18
ATG2P53855 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-4.82□□□□□ -3.18
ATG2P53855 snR34snR34 203 nt-4.82□□□□□ -3.18
ATG2P53855 YJL150WYJL150W 303 nt-4.85□□□□□ -3.19
ATG2P53855 snR60snR60 104 nt-4.88□□□□□ -3.19
ATG2P53855 snR78snR78 87 nt-4.89□□□□□ -3.19
ATG2P53855 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-4.91□□□□□ -3.19
ATG2P53855 YNL324WYNL324W 396 nt-4.93□□□□□ -3.2
ATG2P53855 YNL028WYNL028W 318 nt-4.96□□□□□ -3.2
ATG2P53855 RPL41BYDL133C-A 78 nt-4.97□□□□□ -3.21
ATG2P53855 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-4.98□□□□□ -3.21
ATG2P53855 YNL198CYNL198C 303 nt-4.99□□□□□ -3.21
ATG2P53855 YGL041CYGL041C 204 nt-5□□□□□ -3.21
ATG2P53855 snR54snR54 86 nt-5.04□□□□□ -3.22
ATG2P53855 YDR413CYDR413C 576 nt-5.05□□□□□ -3.22
ATG2P53855 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-5.1□□□□□ -3.23
ATG2P53855 BIL1YOR304C-A 231 nt-5.12□□□□□ -3.23
ATG2P53855 YEL014CYEL014C 306 nt-5.13□□□□□ -3.23
ATG2P53855 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-5.15□□□□□ -3.23
ATG2P53855 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-5.17□□□□□ -3.24
ATG2P53855 YER006C-AYER006C-A 318 nt-5.21□□□□□ -3.24
ATG2P53855 YLR434CYLR434C 384 nt-5.24□□□□□ -3.25
ATG2P53855 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-5.25□□□□□ -3.25
ATG2P53855 Q0255Q0255 1419 nt-5.3□□□□□ -3.26
ATG2P53855 YOR102WYOR102W 351 nt-5.32□□□□□ -3.26
ATG2P53855 snR87snR87 109 nt-5.38□□□□□ -3.27
ATG2P53855 HTL1YCR020W-B 237 nt-5.41□□□□□ -3.28
ATG2P53855 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-5.42□□□□□ -3.28
ATG2P53855 YGR035CYGR035C 351 nt-5.51□□□□□ -3.29
ATG2P53855 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-5.56□□□□□ -3.3
ATG2P53855 RPL41AYDL184C 78 nt-5.59□□□□□ -3.3
ATG2P53855 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-5.59□□□□□ -3.3
ATG2P53855 snR48snR48 113 nt-5.63□□□□□ -3.31
ATG2P53855 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-5.66□□□□□ -3.32
ATG2P53855 YKL118WYKL118W 312 nt-5.67□□□□□ -3.32
ATG2P53855 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-5.68□□□□□ -3.32
ATG2P53855 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-5.69□□□□□ -3.32
ATG2P53855 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-5.71□□□□□ -3.32
ATG2P53855 snR38snR38 95 nt-5.71□□□□□ -3.32
ATG2P53855 YAL066WYAL066W 309 nt-5.73□□□□□ -3.33
ATG2P53855 snR56snR56 88 nt-5.81□□□□□ -3.34
ATG2P53855 GIM4YEL003W 336 nt-5.81□□□□□ -3.34
ATG2P53855 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-5.83□□□□□ -3.34
ATG2P53855 snR85snR85 171 nt-5.85□□□□□ -3.35
ATG2P53855 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-5.88□□□□□ -3.35
ATG2P53855 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-5.96□□□□□ -3.36
ATG2P53855 YNL122CYNL122C 348 nt-6.01□□□□□ -3.37
ATG2P53855 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-6.06□□□□□ -3.38
ATG2P53855 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-6.07□□□□□ -3.38
ATG2P53855 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-6.08□□□□□ -3.38
ATG2P53855 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-6.1□□□□□ -3.39
ATG2P53855 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-6.15□□□□□ -3.39
ATG2P53855 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-6.18□□□□□ -3.4
ATG2P53855 RPL39YJL189W 156 nt-6.18□□□□□ -3.4
ATG2P53855 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-6.19□□□□□ -3.4
ATG2P53855 snR58snR58 96 nt-6.25□□□□□ -3.41
ATG2P53855 YDR157WYDR157W 402 nt-6.28□□□□□ -3.42
ATG2P53855 YKL123WYKL123W 381 nt-6.31□□□□□ -3.42
ATG2P53855 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-6.35□□□□□ -3.43
ATG2P53855 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-6.39□□□□□ -3.43
ATG2P53855 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-6.45□□□□□ -3.44
ATG2P53855 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-6.48□□□□□ -3.45
ATG2P53855 SOM1YEL059C-A 225 nt-6.49□□□□□ -3.45
ATG2P53855 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-6.51□□□□□ -3.45
ATG2P53855 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-6.55□□□□□ -3.46
ATG2P53855 snR47snR47 99 nt-6.55□□□□□ -3.46
ATG2P53855 snR52snR52 92 nt-6.6□□□□□ -3.47
ATG2P53855 YBL053WYBL053W 375 nt-6.65□□□□□ -3.47
ATG2P53855 YOR302WYOR302W 78 nt-6.71□□□□□ -3.48
ATG2P53855 YGR151CYGR151C 336 nt-6.73□□□□□ -3.49
ATG2P53855 SPG3YDR504C 384 nt-6.74□□□□□ -3.49
ATG2P53855 YKL225WYKL225W 348 nt-6.78□□□□□ -3.49
ATG2P53855 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-6.78□□□□□ -3.5
ATG2P53855 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-6.78□□□□□ -3.5
ATG2P53855 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-6.79□□□□□ -3.5
ATG2P53855 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-6.83□□□□□ -3.5
ATG2P53855 YNL170WYNL170W 396 nt-6.92□□□□□ -3.52
ATG2P53855 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-7.01□□□□□ -3.53
ATG2P53855 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-7.11□□□□□ -3.55
ATG2P53855 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-7.12□□□□□ -3.55
ATG2P53855 YNR025CYNR025C 360 nt-7.14□□□□□ -3.55
ATG2P53855 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-7.2□□□□□ -3.56
ATG2P53855 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-7.21□□□□□ -3.56
ATG2P53855 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-7.39□□□□□ -3.59
ATG2P53855 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-7.49□□□□□ -3.61
ATG2P53855 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-7.6□□□□□ -3.63
ATG2P53855 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-7.82□□□□□ -3.66
ATG2P53855 YOR225WYOR225W 330 nt-7.94□□□□□ -3.68
ATG2P53855 snR65snR65 100 nt-8□□□□□ -3.69
ATG2P53855 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-8.06□□□□□ -3.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 66.5 ms