Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-4.09□□□□□ -3.06
SSK2P53599 MPC1YGL080W 393 nt-4.1□□□□□ -3.07
SSK2P53599 snR41snR41 95 nt-4.11□□□□□ -3.07
SSK2P53599 YPR012WYPR012W 255 nt-4.12□□□□□ -3.07
SSK2P53599 YNL198CYNL198C 303 nt-4.14□□□□□ -3.07
SSK2P53599 CSN9YDR179C 489 nt-4.15□□□□□ -3.07
SSK2P53599 snR73snR73 106 nt-4.18□□□□□ -3.08
SSK2P53599 snR80snR80 171 nt-4.19□□□□□ -3.08
SSK2P53599 YJL150WYJL150W 303 nt-4.2□□□□□ -3.08
SSK2P53599 ATP6Q0085 780 nt-4.22□□□□□ -3.08
SSK2P53599 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-4.23□□□□□ -3.09
SSK2P53599 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-4.23□□□□□ -3.09
SSK2P53599 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-4.28□□□□□ -3.09
SSK2P53599 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-4.3□□□□□ -3.1
SSK2P53599 RPL41BYDL133C-A 78 nt-4.33□□□□□ -3.1
SSK2P53599 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-4.33□□□□□ -3.1
SSK2P53599 snR78snR78 87 nt-4.4□□□□□ -3.11
SSK2P53599 BIL1YOR304C-A 231 nt-4.44□□□□□ -3.12
SSK2P53599 snR60snR60 104 nt-4.45□□□□□ -3.12
SSK2P53599 YDR413CYDR413C 576 nt-4.45□□□□□ -3.12
SSK2P53599 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-4.5□□□□□ -3.13
SSK2P53599 YNL324WYNL324W 396 nt-4.51□□□□□ -3.13
SSK2P53599 YNL028WYNL028W 318 nt-4.53□□□□□ -3.13
SSK2P53599 YGL041CYGL041C 204 nt-4.53□□□□□ -3.14
SSK2P53599 Q0255Q0255 1419 nt-4.62□□□□□ -3.15
SSK2P53599 snR34snR34 203 nt-4.62□□□□□ -3.15
SSK2P53599 snR87snR87 109 nt-4.65□□□□□ -3.15
SSK2P53599 snR54snR54 86 nt-4.65□□□□□ -3.15
SSK2P53599 YEL014CYEL014C 306 nt-4.66□□□□□ -3.16
SSK2P53599 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-4.69□□□□□ -3.16
SSK2P53599 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-4.7□□□□□ -3.16
SSK2P53599 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-4.71□□□□□ -3.16
SSK2P53599 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-4.72□□□□□ -3.16
SSK2P53599 YLR434CYLR434C 384 nt-4.74□□□□□ -3.17
SSK2P53599 YOR102WYOR102W 351 nt-4.76□□□□□ -3.17
SSK2P53599 YER006C-AYER006C-A 318 nt-4.81□□□□□ -3.18
SSK2P53599 YGR035CYGR035C 351 nt-4.82□□□□□ -3.18
SSK2P53599 HTL1YCR020W-B 237 nt-4.95□□□□□ -3.2
SSK2P53599 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-4.95□□□□□ -3.2
SSK2P53599 RPL41AYDL184C 78 nt-4.97□□□□□ -3.21
SSK2P53599 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-4.99□□□□□ -3.21
SSK2P53599 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-4.99□□□□□ -3.21
SSK2P53599 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-5.03□□□□□ -3.21
SSK2P53599 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-5.04□□□□□ -3.22
SSK2P53599 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-5.07□□□□□ -3.22
SSK2P53599 snR48snR48 113 nt-5.1□□□□□ -3.23
SSK2P53599 YKL118WYKL118W 312 nt-5.12□□□□□ -3.23
SSK2P53599 snR38snR38 95 nt-5.12□□□□□ -3.23
SSK2P53599 snR85snR85 171 nt-5.15□□□□□ -3.23
SSK2P53599 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-5.19□□□□□ -3.24
SSK2P53599 snR56snR56 88 nt-5.21□□□□□ -3.24
SSK2P53599 GIM4YEL003W 336 nt-5.21□□□□□ -3.24
SSK2P53599 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-5.28□□□□□ -3.25
SSK2P53599 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-5.29□□□□□ -3.26
SSK2P53599 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-5.36□□□□□ -3.27
SSK2P53599 YAL066WYAL066W 309 nt-5.37□□□□□ -3.27
SSK2P53599 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-5.38□□□□□ -3.27
SSK2P53599 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-5.38□□□□□ -3.27
SSK2P53599 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-5.4□□□□□ -3.27
SSK2P53599 snR58snR58 96 nt-5.43□□□□□ -3.28
SSK2P53599 YDR157WYDR157W 402 nt-5.47□□□□□ -3.29
SSK2P53599 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-5.5□□□□□ -3.29
SSK2P53599 RPL39YJL189W 156 nt-5.51□□□□□ -3.29
SSK2P53599 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-5.52□□□□□ -3.29
SSK2P53599 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-5.54□□□□□ -3.3
SSK2P53599 YNL122CYNL122C 348 nt-5.55□□□□□ -3.3
SSK2P53599 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-5.56□□□□□ -3.3
SSK2P53599 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-5.56□□□□□ -3.3
SSK2P53599 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-5.69□□□□□ -3.32
SSK2P53599 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-5.72□□□□□ -3.33
SSK2P53599 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-5.78□□□□□ -3.33
SSK2P53599 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-5.79□□□□□ -3.34
SSK2P53599 SOM1YEL059C-A 225 nt-5.83□□□□□ -3.34
SSK2P53599 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-5.84□□□□□ -3.35
SSK2P53599 snR47snR47 99 nt-5.84□□□□□ -3.35
SSK2P53599 YKL123WYKL123W 381 nt-5.85□□□□□ -3.35
SSK2P53599 YBL053WYBL053W 375 nt-5.89□□□□□ -3.35
SSK2P53599 YNL170WYNL170W 396 nt-5.89□□□□□ -3.35
SSK2P53599 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-5.95□□□□□ -3.36
SSK2P53599 snR52snR52 92 nt-5.95□□□□□ -3.36
SSK2P53599 SPG3YDR504C 384 nt-5.99□□□□□ -3.37
SSK2P53599 YGR151CYGR151C 336 nt-6.03□□□□□ -3.37
SSK2P53599 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-6.03□□□□□ -3.37
SSK2P53599 YKL225WYKL225W 348 nt-6.04□□□□□ -3.38
SSK2P53599 YOR302WYOR302W 78 nt-6.13□□□□□ -3.39
SSK2P53599 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-6.19□□□□□ -3.4
SSK2P53599 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-6.23□□□□□ -3.41
SSK2P53599 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-6.24□□□□□ -3.41
SSK2P53599 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-6.27□□□□□ -3.41
SSK2P53599 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-6.35□□□□□ -3.43
SSK2P53599 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-6.38□□□□□ -3.43
SSK2P53599 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-6.4□□□□□ -3.43
SSK2P53599 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-6.45□□□□□ -3.44
SSK2P53599 YNR025CYNR025C 360 nt-6.61□□□□□ -3.47
SSK2P53599 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-6.83□□□□□ -3.5
SSK2P53599 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-6.91□□□□□ -3.52
SSK2P53599 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-6.99□□□□□ -3.53
SSK2P53599 YOR225WYOR225W 330 nt-7.02□□□□□ -3.53
SSK2P53599 snR40snR40 97 nt-7.12□□□□□ -3.55
SSK2P53599 snR64snR64 101 nt-7.2□□□□□ -3.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.8 ms