Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
J3KRW8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3KRW8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3KRW8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3KRW8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3KRW8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3KRW8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3KRW8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3KRW8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3KRW8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3KRW8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3KRW8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3KRW8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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