Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SENP1Q9P0U3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SENP1Q9P0U3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SENP1Q9P0U3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SENP1Q9P0U3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SENP1Q9P0U3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SENP1Q9P0U3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.5 ms