Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKIRAS1Q9NYS0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKIRAS1Q9NYS0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKIRAS1Q9NYS0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKIRAS1Q9NYS0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms