Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM15Q9C019 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM15Q9C019 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM15Q9C019 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM15Q9C019 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms